Como a abordagem de código aberto está impactando a ciência

Nesta nova categoria da Ciência dentro da It's FOSS, mergulhamos no empolgante mundo da Ciência Inovadora para explorar e descobrir como o Sistema Operacional e o Código Aberto baseados em Linux estão desempenhando um papel significativo nos grandes avanços científicos que estão ocorrendo em nossa empresa. vidas diárias.

O impacto de uma abordagem de código aberto para a ciência

Fonte da imagem: //www.sci-gaia.eu/osp-enab/

Em futuras revisões, nos esforçaremos para explorar os pensamentos mencionados no título deste artigo. Por enquanto, vamos examinar os seguintes pontos-chave:

Transparência

A transparência é uma prática que é considerada altamente valiosa em qualquer projeto que esteja sendo realizado. É tudo sobre como é aberto o processo de distribuição de informações compartilhadas. A transparência torna qualquer tipo de ação sendo implementada facilmente perceptível, pois desempenha um papel significativo na construção de um processo de tomada de decisão eficaz dentro de uma organização ou comunidade. Um exemplo simples de boa prática de transparência seria um conjunto completo de registros de transações entre dois indivíduos ou equipes disponíveis para referência a qualquer momento por ambas as partes.

Embora transparência e código aberto não sejam exatamente os mesmos, ambos compartilham ideologias semelhantes. A Abordagem de Código Aberto sempre traz um impacto positivo na transparência dentro de qualquer equipe de projeto. Uma vez que o código-fonte original está disponível no domínio público e pode ser reaproveitado, torna-se mais fácil para várias colaborações nascer entre diferentes grupos ou equipes para trabalhar no sentido de resolver um problema científico que poderia ajudar a sociedade. Falando de Linux, é sempre a primeira preferência em pesquisa científica considerando a natureza das práticas de software hoje. Baseado em várias observações feitas por pesquisadores, o Linux está sendo preferido primeiro e isso é uma boa notícia!

Qualidade de pesquisa

Pesquisa sem qualidade sempre resulta em redução ou não efetividade. É óbvio como o Linux e o software livre afetariam profundamente a qualidade da pesquisa científica em qualquer lugar do mundo. O efeito sobre a transparência, como discutido acima, também tem outro efeito positivo na pesquisa, porque quando o software usado para realizar qualquer análise científica é de código aberto, torna-se mais simples e mais fácil entender os resultados experimentais e os erros. Ajuda imensamente a isolar a causa de um problema de software. A capacidade de reutilizar o trabalho científico para sua finalidade inicial ou diferente, ou seja, a aplicabilidade só será possível quando o código-fonte original estiver disponível, tornando-o absolutamente pronto para implantar ou depurar depois de fazer atualizações com as alterações necessárias.

Fluxo de Idéias

Como este ponto-chave sugere, o conhecimento científico não deve ser contido. Foi assim que surgiu o conceito de acesso aberto. O Open Source apóia o espírito de liberdade do conhecimento científico com seu modelo aberto. Software proprietário significa código fechado, o que implica falta de transparência na compreensão de como ele realmente funciona. Quando não entendemos como isso realmente funciona a partir do núcleo, não somos impedidos de efetivamente resolver nosso problema direcionado com a precisão necessária? O tempo gasto na replicação ou aprimoramento de tal modelo poderia ter sido bastante reduzido se fosse um código aberto, em primeiro lugar!

Um estudo recente foi publicado pela ScienceDirect, que revelou que é o setor de código aberto que domina a indústria quando comparado ao seu homólogo proprietário quando se considera o longo prazo. Isso foi feito estudando e formulando suas relações mútuas correspondentes a P & D.

Escopo de Melhoria

Um estudo cuidadoso do código-fonte aberto permite que o programador científico anote as possibilidades de melhorias, erros errôneos que podem ser vitais para a precisão científica e implementação de novos recursos. A introdução de novos recursos se torna muito mais fácil, pois o usuário sabe onde implementá-los inteligentemente nos vários fragmentos do código-fonte aberto, cada parte da qual é obviamente acessível.

Poupança no Financiamento

Qualquer pesquisa científica requer financiamento suficiente para trabalhar de forma eficaz em direção a um objetivo fora da lei. Para poder inventar ou descobrir, precisamos de ferramentas. Mas quando se trata de ferramentas de software, fica evidente como a adoção de um modelo de código aberto reduziria os custos. Nós não precisamos comprar um sistema operacional caro enquanto construímos um laboratório de ciências. Os computadores são altamente confiáveis ​​para realizar análises in-silico e, felizmente, temos uma enorme quantidade de sistemas operacionais e softwares científicos de código aberto para trabalhar da mesma forma. O gasto gasto na compra de software proprietário poderia ser justificadamente usado para fazer pesquisas reais apenas usando software de código aberto.

Revistas de código aberto

As revistas científicas são uma fonte confiável de informações e pesquisas. Curiosamente, agora temos até revistas de software exclusivamente para procurar informações de código aberto. Um deles é o JOSS, ou seja, o Journal of Open Source Software, que é um ótimo recurso para navegar em pacotes de software de pesquisa de código aberto. A revista foi especificamente projetada com uma abordagem amigável ao desenvolvedor. Vamos discutir mais tais revistas em artigos futuros.

Ciência Aberta

A Open Science é um movimento que está gradualmente se tornando uma revolução, para tornar todo o trabalho científico disponível para todos, independentemente do status do indivíduo ou do grupo que tenha uma vontade de conhecer ou aprender. Isso foi descrito na imagem em destaque (por Sci-GaIA) deste artigo de uma maneira muito simples. A Sci-GaIA promove o uso e desenvolvimento da infra-estrutura eletrônica na África. A ideia da Open Science data desde os anos 1600! O Open Science é baseado em quatro valores principais: acesso aberto, dados abertos, código aberto e padrões abertos. Muitos países têm projetos de dados abertos completos. Aqui está a França, a Índia e os EUA. Confira esta página de ciência aberta belamente ilustrada e interativa no site da Sci-GaIA!

A seguir estão as leis do Open Science:

  • Primeira lei: todos os dados estão abertos e todas as ideias são compartilhadas
  • Segunda Lei: Qualquer um pode participar em qualquer nível
  • Terceira Lei: Não haverá patentes
  • Quarta Lei: Sugestões são a melhor forma de crítica
  • Quinta Lei: Discussão pública é muito mais valiosa do que e-mail privado
  • Sexta Lei: Um projeto aberto é maior que e não pertence a nenhum laboratório

As leis acima foram estabelecidas pela primeira vez pelo cientista visionário e pesquisador Matt Todd em seu próprio post no blog sobre Open Source Drug Discovery (OSDD - discutido a seguir) para Malária. O vídeo a seguir menciona os três primeiros:

Sua equipe começou a pesquisa de código aberto sobre a malária para combater a doença infame que coloca bilhões de pessoas em todo o mundo em risco até hoje. Chama-se O projeto de código aberto de malária, um recurso de informações relevantes voltadas principalmente para o combate à malária. Aqui está uma publicação abrangente de revista Nature de acesso aberto, discutindo como e por que o Open Source é um Acelerador de Pesquisa!

Descoberta de Medicamentos de Código Aberto (OSDD)

O OSDD é uma iniciativa para descobrir novos medicamentos para combater doenças com uma abordagem Open Source. Bharath Ramsundar, que iniciou o desenvolvimento de uma biblioteca python baseada em aprendizado profundo para descoberta de drogas, ciência de materiais, química quântica e biologia, chamada DeepChem, escreveu um artigo notável sobre Por que a descoberta de medicamentos deveria ser de código aberto. Com o DeepChem como exemplo, ele explicou claramente o conceito, destacando o quão grande é o impacto quando o Software Científico é o Código Aberto.

Nos próximos artigos sobre Ciência, vamos descobrir como as tendências emergentes em vários campos estão evoluindo, repensando-as com uma perspectiva de código aberto.

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